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從病理變化上鑒別：1、豬球蟲病
仔豬球蟲病特征性大體病變是空腸和回腸粘膜出現纖維素性壞死，腸絨毛萎縮和脫落，但只有在嚴重感染的仔豬中出現。
2、仔豬黃痢
主要病變為急性腸炎和敗血癥。頸部、腹部皮下常有水腫，腸內有多量黃色液狀內容物和氣體，腸粘膜有急性卡他性炎癥，腸腔擴張，腸壁很薄，腸粘膜呈紅色，病變以十二指腸黏膜病變最為嚴重，空腸和回腸次之，結腸較輕。腸系膜淋巴結有彌漫性小出血點。肝呈紫紅色和紅黃相間紋樣色調。腎色淡，表面有數量不等針尖大的出血點。心臟擴張，心房、心室充滿凝血塊，心
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