慢性副傷寒由于發病特點、癥狀及剖檢變化都較典型，不難做出診斷。
1、流行病學特點
仔豬副傷寒發生于1～3月齡仔豬，地方流行或散發，流行緩慢。常在飼養管理及衛生條件差的豬場發生。寒冷、氣候多變、陰雨連綿季節多見發生；有降低仔豬抵抗力的多種致病應激因素存在。
2、臨診癥狀
初期急性發生時，與豬瘟、豬丹毒相似，需結合其他材料綜合判斷。慢性病例典型的癥狀是持續性下痢，呈慢性經過；部分仔豬還有肺炎癥狀。
3、病理變化
大腸有典型的潰瘍，或彌漫性壞死，腸壁變厚。肝、淋巴結等為干酪樣壞死等。
4、細茵分離
急性病例需進行實驗室檢查，可從實質器官分離出病原菌，慢性病例不易成功。將分離的沙門氏菌，進行形態、培養特性(包括鑒別培養)、生化試驗及血清學鑒定等。
5、鑒別診斷
急性病例與豬瘟、豬丹毒很相似，除了結合癥狀、病理及流行特點進行分析，綜合判定外，尚需進行實驗室檢查(如對豬瘟進行豬瘟酶標抗體試驗、豬瘟熒光抗體檢驗及豬瘟兔體交互反應等)。
