豬流行性腹瀉病毒(PEDV)為冠狀病毒科冠狀病毒屬的成員。病毒形態略呈球形，在糞便中的病毒粒子常呈現多形態，平均直徑為130nm(95～190nm)。有囊膜，囊膜上有花瓣狀纖突，長12～24nm，由核心向四周放射，其間距較大且排列規則，呈皇冠狀。病毒在蔗糖中的浮密度為1、18g/mL。
病毒核酸為線性單股正鏈RNA，具有侵染性?；蚪M長為27000～33000個核苷酸(nt)，分子量為6×106～8×106。
免疫熒光(IFA)和免疫電鏡(IEM)試驗表明，豬流行性腹瀉病毒與雞傳染性支氣管炎病毒(IBV)、豬血凝性腦脊髓炎病毒(HEV)、新生犢牛腹瀉冠狀病毒(NCDCV)，犬冠狀病毒(CCV)、貓傳染性腹膜炎冠狀病毒(FIPV)之間沒有抗原相關性。但更敏感的試驗檢查表明，其中PEDV的N蛋白和FIPV的N蛋白有一定相關性。中和試驗和ELISA等都證明PEDV和TGEV在抗原性上不同，無共同抗原。目前，尚無跡象表明存在不同的PED血清型，所有分離的PEDV毒株屬于同一個血清型。
本病毒不能凝集人、兔、豬、鼠、犬、馬、羊、牛的紅細胞。對外界抵抗力弱，對乙醚、氯仿敏感，一般消毒藥物都可將其殺滅。病毒在60℃ 30min，可失去感染力，但在50℃條件下相對穩定。病毒在4℃，pH5.0～9.0或在37℃，pH6.5～7.5時穩定。
