在寒冷季節，1～8周齡新生仔豬或剛斷乳仔豬突然發生水樣腹瀉，應考慮輪狀病毒感染。但要與類似疾病如豬傳染性胃腸炎、流行性腹瀉、仔豬黃痢、白痢等鑒別診斷。及時收集疾病急性期糞樣或腸內容物送檢，對正確診斷非常重要。
輪狀病毒的檢測方法很多，首推電子顯微鏡法，其他方法包括：免疫電鏡法、免疫組化法、小腸冰凍切片或觸片免疫熒光法、ELISA、分離病毒、乳汁凝集反應、斑點雜交試驗、RNA電泳分型，以及RT-CR等。
電子顯微鏡法廣泛用于輪狀病毒的檢測，并可作為其他檢測方法的參照性方法。
電鏡負染法應注意染色條件，磷鎢酸(PTA)pH中性時主要出現單殼病毒粒子，但pH4.5時主要顯示雙殼病毒粒子。B群輪狀病毒樣本中可檢測到核心粒子。
免疫電鏡可用于區別不同血清群的輪狀病毒。福爾馬林固定、石蠟包埋的小腸組織切片可用標金蛋白A的免疫染色和特異抗血清的免疫組化法檢測。
ELISA方法常用于檢測糞樣或腸內容物中的輪狀病毒抗原。病毒RNA電泳分型常用于檢測和鑒別輪狀病毒群，但確診還需進行血清學方法或核酸法復核。末端寡核苷酸指紋圖譜已用于鑒別區分豬輪狀病毒，可用在分子流行病學研究中。 imuyi.com
核酸探針和RT―PCR技術可用來檢測和區分輪狀病毒及血清型。血清學試驗用于診斷意義不大，但抗體滴度和血清分型可以表示出動物的免疫狀態。常用血清學方法有間接免疫熒光試驗?？瞻邷p少和熒光灶減少中和試驗可用于檢測中和抗體。血凝抑制試驗也被用于檢測豬輪狀病毒抗體。人的診斷試劑盒也可用于豬A群輪狀病毒的檢測。
