豬自然感染輪狀病毒后，可產生循環抗體(IgG與IgM)和分泌性抗體(sIgA)，但提供保護作用的抗體是血液、腸黏膜及乳汁中的分泌型IgA(sIgA)。但乳中的母源抗體很可能會干擾經口免疫的輪狀病毒的復制。循環抗體不能保護仔豬免受輪狀病毒感染。
疫苗與免疫途徑是影響免疫效果的主要因素。活病毒疫苗經口免疫是最為有效的免疫方法，可顯著誘導腸道黏膜產生中和抗體IgA與記憶性B細胞，并提供對強毒攻擊的免疫保護。
非復制型病毒疫苗(滅活病毒或類病毒顆粒VLP)及非消化道免疫途徑(肌肉注射、腹腔注射及鼻黏膜免疫等)不能誘導有效的保護性免疫反應。
綜合上述疫苗與免疫途徑的聯合接種方案可提供更好的免疫保護。首免用活病毒疫苗經口免疫，加強免疫由非消化道途徑用非復制性病毒疫苗配以適當佐劑接種，獲得的免疫效果顯著高于各疫苗的單獨接種。
已證明輪狀病毒的免疫具有血清型特異性。VP4和VP7是兩種重要的保護性抗原。除具有血清型特異性的抗原表位外，這些蛋白還具有異型抗原表位，但異型免疫的免疫效果不如同型毒株好。
通過利用兩種不同血清型的VP4和VP7基因構建重組病毒或重組蛋白亞單位疫苗，可望誘導仔豬產生針對兩種血清型的免疫力。
豬輪狀病毒感染尚無特效治療藥。通過加強管理和抗生素治療可以減少由輪狀病毒和繼發細菌感染引起的死亡。
自由飲用含葡萄糖-甘氨酸的電解質流液，或靜脈注射葡萄糖鹽水和碳酸氫鈉溶液，可最大限度地防止脫水與酸中毒。
保持良好的周圍環境，減少賊風和溫度的波動。在持續存在斷奶后腹瀉且死亡率又高的豬場，飼喂高能斷乳飼料可成功地降低發病率和死亡率。
預防主要依靠加強飼養管理，如搞好清潔衛生與消毒，遵循“全進全出”的管理模式，仔豬盡早吃初乳，不能早斷乳。嚴格執行獸醫一般防疫措施，增強母豬和仔豬的抗病力。母豬免疫接種可以保護新生仔豬免受感染。 imuyi.com
目前，市場上有針對母豬和哺育豬免疫用的輪狀病毒活毒苗和滅活苗供應。據報道能給仔豬提供有效的免疫保護。各種新型疫苗如亞單位疫苗等正在研制之中。
