豬傳染性腦脊髓炎的病原為豬腸病毒(Porcine enterovirus)，屬于微RNA病毒科(Picornaviridae)、腸病毒屬(Enterovirus)。病毒粒子呈球形，直徑22～30nm、無囊膜，無脂蛋白，核衣殼呈20面體對稱，基因組為單股RNA。
豬腸病毒在熱和pH3～9的環境下相對較穩定。其血清1型在15℃可存活168天。無血凝活性。對多種消毒劑都有抵抗力，但3%福爾馬林溶液、20%漂白粉溶液可滅活病毒。
該病毒容易在豬源細胞上增殖，如PK細胞系、IBRS-Z、SST細胞系或豬腎原代細胞，增殖時可產生細胞病變即細胞圓縮、壞死，亦可形成蝕斑。
豬腸病毒與其他微RNA病毒一樣，有C抗原和D抗原。由于C抗原同時也存在于許多其他病毒株，因此，該病毒與馬鼻病毒、柯薩奇病毒、脊髓灰質炎病毒在瓊脂擴散中有交叉反應。
依據血清學中和試驗可將豬腸病毒分為11個血清型。引起豬傳染性腦脊髓炎的主要為豬腸病毒1型，2型、5型也可成為本病的病原。
